20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4609 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  94.39 
 
 		 108 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  87.04 
 
 		 108 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  73.33 
 
 		 108 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  47.13 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  44.34 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1873  hypothetical protein  41.58 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  37.78 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53870  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03808  hypothetical protein  42.62 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4716  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1107  hypothetical protein  32.63 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3598  hypothetical protein  43.75 
 
 		 275 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.356633  normal  0.227709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1369  hypothetical protein  46 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600356  normal  0.166783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3309  hypothetical protein  33.67 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0271  hypothetical protein  45.16 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  31.18 
 
 		 113 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  28.57 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>