18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03808 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03808  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  204  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  54 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  46.51 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  48.78 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  43.68 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0264  hypothetical protein  36.89 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  42.53 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0148  putative iron uptake protein  47.69 
 
 
115 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.157544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53870  hypothetical protein  39.25 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  44.87 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  42.5 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4716  hypothetical protein  37.38 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0271  hypothetical protein  44.44 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  35.8 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  32.47 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1873  hypothetical protein  32.81 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  32.04 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>