20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0271 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  41.46 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3523  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.490559  normal  0.659494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  36.05 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03808  hypothetical protein  44.26 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2053  hypothetical protein  37.08 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1369  hypothetical protein  52.17 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600356  normal  0.166783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  35.37 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0148  putative iron uptake protein  40.58 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  37.35 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  38.55 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  35.62 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  36.14 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  37.35 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  33.73 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  30.67 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2855  hypothetical protein  36.26 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0866118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1107  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3309  hypothetical protein  32.94 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>