20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1107 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1107  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  230  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  37.21 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  34.65 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1873  hypothetical protein  38.89 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  35.44 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  34.88 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3523  hypothetical protein  37.21 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.490559  normal  0.659494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  36.59 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  36.78 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53870  hypothetical protein  37.18 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1369  hypothetical protein  38.37 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600356  normal  0.166783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  34.31 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  32.63 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0271  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4599  putative iron uptake protein  38.57 
 
 		 116 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  32.95 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1147  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.46677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1217  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1146  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4486  putative iron uptake protein  38.57 
 
 		 116 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>