17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1212 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  62.07 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  41.51 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  40.95 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  41.51 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  36.84 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  40.24 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  35.51 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  38.1 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53870  hypothetical protein  37.63 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0148  putative iron uptake protein  38.46 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03808  hypothetical protein  45.59 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4716  hypothetical protein  36.56 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1873  hypothetical protein  38.2 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0271  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0264  hypothetical protein  25.23 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>