23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25310 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  100 
 
 		 108 aa  206  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  39.08 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  40.23 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  36.46 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  37.14 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  38.82 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4716  hypothetical protein  41.86 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53870  hypothetical protein  40.7 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03808  hypothetical protein  47.62 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0264  hypothetical protein  32.97 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1873  hypothetical protein  36.36 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0148  putative iron uptake protein  39.47 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  32.18 
 
 		 108 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3598  hypothetical protein  39.08 
 
 		 275 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.356633  normal  0.227709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  36.08 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1369  hypothetical protein  37.66 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600356  normal  0.166783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  32.95 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1107  hypothetical protein  35.79 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4292  hypothetical protein  30.3 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  28.24 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0108  hypothetical protein  30.3 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0271  hypothetical protein  35.37 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>