14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4716 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4716  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  203  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53870  hypothetical protein  92.52 
 
 
107 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  41.38 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4370  hypothetical protein  36.96 
 
 
122 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  43.42 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4236  hypothetical protein  36.96 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  40.62 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  40.43 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  36.36 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4164  hypothetical protein  34.78 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  36.56 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03808  hypothetical protein  40.3 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  34.29 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>