22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1343 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  223  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3309  hypothetical protein  71.56 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  57.69 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1146  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1217  hypothetical protein  50.49 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1147  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.46677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3078  hypothetical protein  52.22 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.963714  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1312  hypothetical protein  52.22 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234542  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1235  hypothetical protein  52.22 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1279  hypothetical protein  52.22 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3408  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1238  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0278337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2729  hypothetical protein  51.72 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2357  hypothetical protein  41.3 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.532778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0108  hypothetical protein  29.47 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4292  hypothetical protein  29.47 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  31.25 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4432  hypothetical protein  28.42 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  36.14 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  28.41 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  34.26 
 
 		 108 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>