24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4118 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4118  putative iron uptake protein  100 
 
 		 116 aa  216  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.74371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4486  putative iron uptake protein  99.12 
 
 		 116 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4599  putative iron uptake protein  95.7 
 
 		 116 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0148  putative iron uptake protein  48 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  42.17 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0264  hypothetical protein  34.78 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  36.11 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  43.68 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  36.14 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  35 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  35.63 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1873  hypothetical protein  40.74 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  32.35 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3309  hypothetical protein  30.59 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03808  hypothetical protein  38.1 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1107  hypothetical protein  31.91 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  32.14 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  29.41 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4292  hypothetical protein  32.22 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53870  hypothetical protein  35.23 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0108  hypothetical protein  32.14 
 
 		 108 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4716  hypothetical protein  34.09 
 
 		 107 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>