18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2088 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3072  endonuclease  51.87 
 
 		 966 aa  954    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.955315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2088  endonuclease  100 
 
 		 955 aa  1971    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895956  normal  0.207443 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0278  endonuclease  54.86 
 
 		 951 aa  1009    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0007  hypothetical protein  48.96 
 
 		 964 aa  864    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0754  Putative endonuclease, Z1 domain protein  40.41 
 
 		 929 aa  595  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2744  hypothetical protein  40.64 
 
 		 918 aa  572  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4267  endonuclease  34.54 
 
 		 899 aa  456  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2369  endonuclease  31.96 
 
 		 895 aa  372  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173223  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2863  endonuclease  32.2 
 
 		 872 aa  320  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0373  endonuclease  29.51 
 
 		 908 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0935  endonuclease  39.61 
 
 		 556 aa  280  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000880846 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04281  hypothetical protein  27.99 
 
 		 901 aa  239  2e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0936  endonuclease  35.28 
 
 		 348 aa  204  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0574  hypothetical protein  29.67 
 
 		 967 aa  159  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1320  hypothetical protein  26.82 
 
 		 702 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221538  unclonable  0.0000204727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3931  hypothetical protein  26.2 
 
 		 732 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1334  hypothetical protein  24.01 
 
 		 691 aa  108  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0368  hypothetical protein  25.55 
 
 		 620 aa  91.3  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>