18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2369 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2369  endonuclease  100 
 
 		 895 aa  1850    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173223  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4267  endonuclease  34.09 
 
 		 899 aa  416  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3072  endonuclease  33.86 
 
 		 966 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.955315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2088  endonuclease  31.96 
 
 		 955 aa  372  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895956  normal  0.207443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0754  Putative endonuclease, Z1 domain protein  35.98 
 
 		 929 aa  366  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0278  endonuclease  33.6 
 
 		 951 aa  352  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0007  hypothetical protein  30.13 
 
 		 964 aa  343  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2744  hypothetical protein  31.4 
 
 		 918 aa  331  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277098  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2863  endonuclease  29.99 
 
 		 872 aa  265  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0373  endonuclease  30.85 
 
 		 908 aa  230  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0935  endonuclease  36.16 
 
 		 556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000880846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0574  hypothetical protein  29.33 
 
 		 967 aa  210  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04281  hypothetical protein  26.42 
 
 		 901 aa  185  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1320  hypothetical protein  26.88 
 
 		 702 aa  131  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221538  unclonable  0.0000204727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0936  endonuclease  48.7 
 
 		 348 aa  120  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3931  hypothetical protein  25.89 
 
 		 732 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1334  hypothetical protein  24.09 
 
 		 691 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0368  hypothetical protein  24.68 
 
 		 620 aa  94.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>