16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0936 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0936  endonuclease  100 
 
 		 348 aa  718    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112405 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2088  endonuclease  35.28 
 
 		 955 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895956  normal  0.207443 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0007  hypothetical protein  34.65 
 
 		 964 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0278  endonuclease  35.6 
 
 		 951 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3072  endonuclease  32.22 
 
 		 966 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.955315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0754  Putative endonuclease, Z1 domain protein  35.47 
 
 		 929 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2744  hypothetical protein  33.43 
 
 		 918 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4267  endonuclease  30.9 
 
 		 899 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2863  endonuclease  27.68 
 
 		 872 aa  129  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2369  endonuclease  48.7 
 
 		 895 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173223  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0373  endonuclease  32.26 
 
 		 908 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0574  hypothetical protein  36.36 
 
 		 967 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04281  hypothetical protein  48.94 
 
 		 901 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3931  hypothetical protein  40 
 
 		 732 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1320  hypothetical protein  38.27 
 
 		 702 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221538  unclonable  0.0000204727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1334  hypothetical protein  33.77 
 
 		 691 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>