18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3931 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3931  hypothetical protein  100 
 
 
732 aa  1509    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1334  hypothetical protein  31.16 
 
 
691 aa  287  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854082  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1320  hypothetical protein  32.09 
 
 
702 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221538  unclonable  0.0000204727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0368  hypothetical protein  29.55 
 
 
620 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0007  hypothetical protein  27.06 
 
 
964 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2369  endonuclease  25.89 
 
 
895 aa  124  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173223  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0574  hypothetical protein  26.88 
 
 
967 aa  122  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2744  hypothetical protein  26.09 
 
 
918 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2088  endonuclease  26.2 
 
 
955 aa  117  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895956  normal  0.207443 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04281  hypothetical protein  26.21 
 
 
901 aa  114  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0754  Putative endonuclease, Z1 domain protein  26.21 
 
 
929 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4267  endonuclease  26.68 
 
 
899 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2863  endonuclease  26.92 
 
 
872 aa  109  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495592  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3072  endonuclease  26.65 
 
 
966 aa  108  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.955315  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0278  endonuclease  23.93 
 
 
951 aa  106  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0373  endonuclease  24.6 
 
 
908 aa  99.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0936  endonuclease  40 
 
 
348 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0935  endonuclease  24.48 
 
 
556 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000880846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>