18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_04281 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_04281  hypothetical protein  100 
 
 
901 aa  1836    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0373  endonuclease  40.96 
 
 
908 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2863  endonuclease  32.84 
 
 
872 aa  357  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495592  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2744  hypothetical protein  26.25 
 
 
918 aa  253  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2088  endonuclease  27.99 
 
 
955 aa  248  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895956  normal  0.207443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0754  Putative endonuclease, Z1 domain protein  28.02 
 
 
929 aa  244  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0278  endonuclease  28.36 
 
 
951 aa  240  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0007  hypothetical protein  29.15 
 
 
964 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0574  hypothetical protein  29.89 
 
 
967 aa  230  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3072  endonuclease  25.8 
 
 
966 aa  227  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.955315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4267  endonuclease  26.74 
 
 
899 aa  204  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2369  endonuclease  26.58 
 
 
895 aa  187  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173223  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0935  endonuclease  27.75 
 
 
556 aa  144  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000880846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1320  hypothetical protein  28.6 
 
 
702 aa  144  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221538  unclonable  0.0000204727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3931  hypothetical protein  26.21 
 
 
732 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1334  hypothetical protein  24.91 
 
 
691 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0368  hypothetical protein  26.25 
 
 
620 aa  98.6  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0936  endonuclease  48.94 
 
 
348 aa  90.5  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>