18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0373 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0373  endonuclease  100 
 
 
908 aa  1854    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04281  hypothetical protein  40.85 
 
 
901 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2863  endonuclease  33.95 
 
 
872 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495592  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2088  endonuclease  29.51 
 
 
955 aa  305  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895956  normal  0.207443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3072  endonuclease  28.96 
 
 
966 aa  293  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.955315  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0278  endonuclease  31.65 
 
 
951 aa  293  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0007  hypothetical protein  29.93 
 
 
964 aa  278  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2744  hypothetical protein  26.38 
 
 
918 aa  271  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0754  Putative endonuclease, Z1 domain protein  28.21 
 
 
929 aa  260  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4267  endonuclease  29.14 
 
 
899 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2369  endonuclease  30.85 
 
 
895 aa  229  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173223  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0574  hypothetical protein  30.41 
 
 
967 aa  185  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0935  endonuclease  33.33 
 
 
556 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000880846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1320  hypothetical protein  27.84 
 
 
702 aa  158  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221538  unclonable  0.0000204727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1334  hypothetical protein  27.67 
 
 
691 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0368  hypothetical protein  28.02 
 
 
620 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0936  endonuclease  32.26 
 
 
348 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3931  hypothetical protein  24.6 
 
 
732 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>