18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1334 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1334  hypothetical protein  100 
 
 
691 aa  1406    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3931  hypothetical protein  31.45 
 
 
732 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0368  hypothetical protein  26.79 
 
 
620 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1320  hypothetical protein  27.32 
 
 
702 aa  171  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221538  unclonable  0.0000204727 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0373  endonuclease  28.44 
 
 
908 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0278  endonuclease  25.05 
 
 
951 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4267  endonuclease  26.6 
 
 
899 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2744  hypothetical protein  24.32 
 
 
918 aa  121  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2088  endonuclease  24.95 
 
 
955 aa  111  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895956  normal  0.207443 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04281  hypothetical protein  25.23 
 
 
901 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0007  hypothetical protein  24.21 
 
 
964 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3072  endonuclease  23.88 
 
 
966 aa  106  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.955315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0754  Putative endonuclease, Z1 domain protein  24.4 
 
 
929 aa  104  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2369  endonuclease  24.05 
 
 
895 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173223  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2863  endonuclease  25.39 
 
 
872 aa  92.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495592  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0574  hypothetical protein  24.56 
 
 
967 aa  78.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0935  endonuclease  25 
 
 
556 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000880846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0936  endonuclease  33.77 
 
 
348 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>