18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4267 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4267  endonuclease  100 
 
 
899 aa  1833    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0754  Putative endonuclease, Z1 domain protein  38.9 
 
 
929 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2088  endonuclease  34.54 
 
 
955 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895956  normal  0.207443 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0278  endonuclease  37.47 
 
 
951 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3072  endonuclease  33.79 
 
 
966 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.955315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2744  hypothetical protein  34.59 
 
 
918 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0007  hypothetical protein  36.98 
 
 
964 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2369  endonuclease  34.09 
 
 
895 aa  415  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173223  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2863  endonuclease  31.9 
 
 
872 aa  293  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495592  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0935  endonuclease  36.83 
 
 
556 aa  262  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000880846 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0373  endonuclease  29.14 
 
 
908 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0574  hypothetical protein  30.77 
 
 
967 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04281  hypothetical protein  28.27 
 
 
901 aa  203  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0936  endonuclease  31.52 
 
 
348 aa  160  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1320  hypothetical protein  28.24 
 
 
702 aa  131  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221538  unclonable  0.0000204727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1334  hypothetical protein  25.76 
 
 
691 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0368  hypothetical protein  26.76 
 
 
620 aa  111  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3931  hypothetical protein  26.68 
 
 
732 aa  107  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>