17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0935 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0935  endonuclease  100 
 
 		 556 aa  1151    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000880846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0754  Putative endonuclease, Z1 domain protein  38.68 
 
 		 929 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0278  endonuclease  38.9 
 
 		 951 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0007  hypothetical protein  39.41 
 
 		 964 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3072  endonuclease  37.18 
 
 		 966 aa  281  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.955315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2088  endonuclease  39.61 
 
 		 955 aa  280  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895956  normal  0.207443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4267  endonuclease  36.83 
 
 		 899 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2744  hypothetical protein  36.01 
 
 		 918 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277098  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2369  endonuclease  36.16 
 
 		 895 aa  219  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173223  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2863  endonuclease  30.59 
 
 		 872 aa  182  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0373  endonuclease  33.33 
 
 		 908 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0574  hypothetical protein  32.35 
 
 		 967 aa  169  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04281  hypothetical protein  27.75 
 
 		 901 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1320  hypothetical protein  24.57 
 
 		 702 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221538  unclonable  0.0000204727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1334  hypothetical protein  24.59 
 
 		 691 aa  70.5  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0368  hypothetical protein  27.95 
 
 		 620 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3931  hypothetical protein  24.48 
 
 		 732 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>