72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03330 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03330  avirulence protein AvrBs2  100 
 
 		 660 aa  1357    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2347  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.88 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0289  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.94 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000460879  normal  0.30528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0895  phosphodiesterase-like  33.33 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1123  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.82 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.84 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.979822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.59 
 
 		 256 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1460  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.16 
 
 		 229 aa  57  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00770  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.85 
 
 		 707 aa  55.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.233657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2174  hypothetical protein  35.92 
 
 		 271 aa  53.9  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1686  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.1 
 
 		 273 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000482632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1922  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.04 
 
 		 257 aa  53.5  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372614  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0251  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.58 
 
 		 256 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6538  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.46 
 
 		 255 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1875  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.37 
 
 		 254 aa  53.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2203  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.69 
 
 		 246 aa  52.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0957  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.63 
 
 		 247 aa  51.6  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.29 
 
 		 237 aa  51.2  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000224371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2709  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.06 
 
 		 258 aa  50.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0834008  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4812  predicted protein  51.79 
 
 		 314 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0188  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.25 
 
 		 227 aa  49.3  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.620509 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1047  hypothetical protein  27.13 
 
 		 282 aa  49.3  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1855  glycerophosphodiester phosphodiesterase  39.08 
 
 		 271 aa  49.7  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1116  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.25 
 
 		 337 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3733  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.71 
 
 		 281 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000178181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1894  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.71 
 
 		 266 aa  49.3  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637186  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2900  hypothetical protein  35.63 
 
 		 260 aa  48.5  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3042  hypothetical protein  34.41 
 
 		 260 aa  48.5  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.65 
 
 		 236 aa  48.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0853  glycerophosphodiester phosphodiesterase  48.84 
 
 		 247 aa  48.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.79 
 
 		 250 aa  48.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04965  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.19 
 
 		 225 aa  47.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0709  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.75 
 
 		 229 aa  48.1  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000121711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2091  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.49 
 
 		 220 aa  47.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3412  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 		 258 aa  47.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.62 
 
 		 594 aa  47.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2653  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.25 
 
 		 257 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2051  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  48.78 
 
 		 245 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.93 
 
 		 258 aa  47.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3486  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase- like protein  33.04 
 
 		 281 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2929  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.83 
 
 		 251 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000223394  hitchhiker  0.00000900382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7459  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.1 
 
 		 251 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2320  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.86 
 
 		 249 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0617  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.32 
 
 		 227 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0136  cytosolic glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.76 
 
 		 257 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3143  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.19 
 
 		 257 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0910478 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02734  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.09 
 
 		 304 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3189  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.5 
 
 		 233 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.772379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.5 
 
 		 491 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3985  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.27 
 
 		 276 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.45 
 
 		 253 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.45 
 
 		 253 aa  45.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.45 
 
 		 253 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0113118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.27 
 
 		 276 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.19 
 
 		 369 aa  45.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18890  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.69 
 
 		 266 aa  45.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.231649  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3104  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.77 
 
 		 255 aa  45.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1886  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.48 
 
 		 235 aa  45.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2973  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.1 
 
 		 268 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4097  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.84 
 
 		 276 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1283  glycerophosphodiester phosphodiesterase  42.86 
 
 		 261 aa  45.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.1 
 
 		 233 aa  44.3  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2407  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40 
 
 		 250 aa  44.3  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.724875  normal  0.178587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1882  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 		 282 aa  43.9  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000161512  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.1 
 
 		 249 aa  44.3  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.99 
 
 		 257 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  35.53 
 
 		 241 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0112  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.96 
 
 		 260 aa  43.9  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  35.53 
 
 		 241 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.66 
 
 		 278 aa  43.9  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3909  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.39 
 
 		 270 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0841832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.06 
 
 		 248 aa  43.9  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>