65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00604 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00604  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  100 
 
 		 118 aa  233  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.993352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1535  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  62.39 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0342  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  56.78 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0378  succinate dehydrogenase membrane anchor subunit  55.93 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0072  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  36.21 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0481  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  37.38 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376521  normal  0.74591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0218  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.51 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2798  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  32.2 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0046  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  31.48 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.200427  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0951  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  35.19 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.91234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1312  succinate dehydrogenase subunit C  37.19 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.115831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1904  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  36.11 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3892  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.51 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3600  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.51 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1433  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  38.89 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1832  succinate dehydrogenase, cytochrome B subunit  36.11 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.725413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3616  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  35.71 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0175322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2867  putative succinate dehydrogenase cytochrome b subunit  34.62 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0327  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  35.34 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1332  succinate dehydrogenase subunit C  35.9 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.956048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4276  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  32.74 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.655158  normal  0.991601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0457  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  33.63 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3565  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  33.63 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6038  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  33.33 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0228  succinate dehydrogenase subunit C  32.11 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0494425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7246  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  33.33 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.786807  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0086  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  32.99 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1967  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  33.33 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2634  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  32.69 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0974  succinate dehydrogenase subunit C  32.69 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3021  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  34.23 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2751  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.87 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2848  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  34.09 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1744  succinate dehydrogenase subunit C  31.2 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.807466  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3692  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.48 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0567  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  32.95 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.592184  normal  0.0786377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3980  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.48 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3030  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  36.63 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2959  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  30.56 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0396146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0088  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  26.61 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0811  succinate dehydrogenase subunit C  30.77 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4137  succinate dehydrogenase cytochrome B-556 subunit  31.33 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1150  fumarate reductase, D subunit  27.59 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1879  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  32.95 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.554321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1548  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit, putative  27.78 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.868422  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4840  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.25 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00670  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0855  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  29.41 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000446892 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0888  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  29.41 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171127  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0765  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  29.41 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.463239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0826  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  29.41 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0813  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  29.41 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.280294  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00681  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  29.41 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0791  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  29.41 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51944  normal  0.101074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0640  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  29.41 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2934  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  29.41 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0748  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  29.41 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0769  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  29.41 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1222  succinate dehydrogenase subunit C  30.39 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0733546 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2914  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  29.41 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0623319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0734  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  28.43 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.934433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3246  succinate dehydrogenase subunit C  26.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1213  succinate dehydrogenase subunit C  26.47 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.101411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2005  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  23.53 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0924289  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01351  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  28.32 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>