84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4840 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4840  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  100 
 
 		 135 aa  270  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3616  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  41.94 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0175322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0072  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  43.55 
 
 		 132 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0481  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  43.55 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376521  normal  0.74591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0218  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  42.74 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2798  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  41.13 
 
 		 141 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1904  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  40 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1433  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  44.17 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1832  succinate dehydrogenase, cytochrome B subunit  40 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.725413  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0951  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  40 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.91234  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0046  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  38.84 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.200427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1967  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  40.34 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0327  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  43.55 
 
 		 132 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1332  succinate dehydrogenase subunit C  41.18 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.956048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3565  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  41.73 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3980  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  43.7 
 
 		 131 aa  83.6  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3692  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  43.7 
 
 		 131 aa  83.6  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2751  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  39.52 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4276  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  40.34 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.655158  normal  0.991601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7246  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  41.18 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.786807  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0457  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  37.21 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3600  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  41.18 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3892  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  41.18 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6038  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  40.34 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0228  succinate dehydrogenase subunit C  40.74 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0494425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2848  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  37.82 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1535  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  37.6 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2959  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  36.97 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0396146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1312  succinate dehydrogenase subunit C  39.52 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.115831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2867  putative succinate dehydrogenase cytochrome b subunit  39.2 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4137  succinate dehydrogenase cytochrome B-556 subunit  37.27 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1879  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  44 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.554321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1202  succinate dehydrogenase subunit C  43.16 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.824011  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2109  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  33.62 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0088  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.71 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0342  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  37.7 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0086  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  39.05 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2634  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  36.04 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0974  succinate dehydrogenase subunit C  36.04 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3246  succinate dehydrogenase subunit C  34.48 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3021  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  32.2 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0378  succinate dehydrogenase membrane anchor subunit  39.78 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3030  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  41.28 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1548  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit, putative  38.3 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.868422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1744  succinate dehydrogenase subunit C  36.72 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.807466  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0567  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  32.81 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.592184  normal  0.0786377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0811  succinate dehydrogenase subunit C  32.43 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2507  succinate dehydrogenase subunit C  38.95 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1610  succinate dehydrogenase subunit C  36.28 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467782  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2195  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  32.14 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44060  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  36.07 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3693  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.25 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1661  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.74 
 
 		 128 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3764  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.74 
 
 		 128 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4193  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.74 
 
 		 128 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.530712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3516  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.74 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00604  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.25 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.993352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2005  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  29.46 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0924289  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00670  hypothetical protein  27.78 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00681  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  27.78 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0918  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  26.45 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.798189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1222  succinate dehydrogenase subunit C  28.8 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0733546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2934  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  27.78 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0813  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  27.78 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.280294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0748  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  27.78 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0640  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  27.78 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0769  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  27.78 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2914  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  27.78 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0623319  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1150  fumarate reductase, D subunit  29.75 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0734  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  26.98 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.934433 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0189  succinate dehydrogenase subunit C  27.05 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3525  succinate dehydrogenase subunit C  32.31 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2818  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  33.33 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0076202  normal  0.952071 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0593  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  27.64 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0574  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  27.64 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08793  Cytochrome B-560 subunit of succinate dehydrogenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASD7]  30.89 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0953988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0855  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  26.19 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000446892 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0826  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  26.19 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0765  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  26.19 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.463239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0888  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  26.19 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171127  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0791  succinate dehydrogenase cytochrome b556 large membrane subunit  26.19 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51944  normal  0.101074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2110  succinate dehydrogenase subunit C  27.97 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000314056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1833  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.51 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00848853  normal  0.0380637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1784  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  28.91 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000397756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>