35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2062 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2062  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00310711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1872  hypothetical protein  91.87 
 
 		 123 aa  231  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  30.34 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  26.8 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  26.8 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  26.85 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  26.8 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  26.8 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  28.42 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  28.4 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  28.4 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  28.4 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  29.03 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  29.47 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  26.32 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  25.93 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  25.32 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  27.16 
 
 		 107 aa  43.5  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  28.21 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  28.21 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  23.08 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  25.93 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  25.58 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  21.36 
 
 		 127 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  27.16 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  23.46 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  26.74 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>