78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5867 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5867  peptidase M23B  100 
 
 
232 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  98.6 
 
 
428 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  71.67 
 
 
434 aa  307  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  68.24 
 
 
428 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  68.67 
 
 
438 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  67.43 
 
 
441 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  67.43 
 
 
440 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  66.38 
 
 
416 aa  286  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  68.67 
 
 
438 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  68.24 
 
 
438 aa  278  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  54.59 
 
 
420 aa  208  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  31.44 
 
 
374 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  33.33 
 
 
379 aa  95.5  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  32.11 
 
 
411 aa  89.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  28.71 
 
 
366 aa  85.1  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  27.16 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  27.16 
 
 
380 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  31.9 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  31.84 
 
 
405 aa  82.4  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  31.43 
 
 
413 aa  82  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  30.94 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  33.48 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  30.23 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  30.99 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  31.02 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  31.33 
 
 
433 aa  68.6  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  39.68 
 
 
417 aa  68.6  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  28.5 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  28.24 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  25.35 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  30.71 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  30.71 
 
 
362 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  26.34 
 
 
436 aa  67  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  30.71 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  27.88 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  27.88 
 
 
427 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  27.88 
 
 
427 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  27.88 
 
 
427 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  30.71 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  25.99 
 
 
377 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  25.99 
 
 
377 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  31.93 
 
 
433 aa  65.1  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  33.33 
 
 
412 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  26.44 
 
 
419 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  26.44 
 
 
419 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  26.44 
 
 
419 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  26.44 
 
 
427 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  26.44 
 
 
419 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  33.03 
 
 
344 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  26.44 
 
 
427 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  26.44 
 
 
427 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  26.44 
 
 
419 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  30.19 
 
 
377 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  28.89 
 
 
378 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  29.14 
 
 
378 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  26.44 
 
 
427 aa  62.4  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  28.21 
 
 
427 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  30.28 
 
 
424 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  28.68 
 
 
377 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  27.72 
 
 
424 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  30.97 
 
 
377 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  28.18 
 
 
444 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  28.81 
 
 
427 aa  55.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  25.84 
 
 
432 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  33.33 
 
 
405 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  32.26 
 
 
382 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  24.77 
 
 
481 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  29.78 
 
 
456 aa  48.5  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  29.78 
 
 
456 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  29.78 
 
 
456 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  30.32 
 
 
398 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  26.19 
 
 
477 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.4 
 
 
391 aa  45.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  25.43 
 
 
379 aa  45.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  27.08 
 
 
379 aa  45.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  27.19 
 
 
382 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  27.31 
 
 
375 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  23.61 
 
 
376 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>