12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2458 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2458  alginate lyase  100 
 
 		 228 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.116563  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1989  alginate lyase 2  61.88 
 
 		 224 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0130582  hitchhiker  0.000160106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3774  alginate lyase 2  61.43 
 
 		 224 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2129  alginate lyase 2  60.54 
 
 		 224 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350709  hitchhiker  0.00000589655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3207  alginate lyase 2  62.78 
 
 		 224 aa  287  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49320  hypothetical protein  23.32 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52458  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3605  lyase, putative  24.69 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.903035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3057  hypothetical protein  24.61 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0328593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3376  lyase, putative  22.45 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41500  putative lyase  21.67 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3520  hypothetical protein  21.67 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2102  hypothetical protein  25.9 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00164411  normal  0.0561114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>