161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4661 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
223 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4523  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  98.98 
 
 
196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  96.43 
 
 
196 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.851348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0775  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  92.86 
 
 
196 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30740  putative NADPH specific quinone oxidoreductase  87.18 
 
 
196 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000815222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2636  modulator of drug activity B  87.69 
 
 
196 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0718  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  82.38 
 
 
196 aa  344  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745565  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3168  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  79.49 
 
 
195 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285135  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46260  quinone NAD(P)H:oxidoreductase MdaB  69.95 
 
 
194 aa  291  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2801  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  65.8 
 
 
194 aa  277  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0330  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  63.54 
 
 
193 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  64.06 
 
 
193 aa  275  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1626  modulator of drug activity B  65.26 
 
 
193 aa  271  4.0000000000000004e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0672  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  65.28 
 
 
193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4336  modulator of drug activity B  65.28 
 
 
193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3461  modulator of drug activity B  65.28 
 
 
193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3206  modulator of drug activity B  65.28 
 
 
193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3492  modulator of drug activity B  65.28 
 
 
193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0669  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  65.28 
 
 
193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0139266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3316  modulator of drug activity B  65.28 
 
 
193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.101813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3431  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  64.58 
 
 
193 aa  265  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3612  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  62.5 
 
 
193 aa  264  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3364  NADPH-specific quinone oxidoreductase  64.06 
 
 
193 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3531  NADPH-specific quinone oxidoreductase  64.06 
 
 
193 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3436  NADPH-specific quinone oxidoreductase  64.06 
 
 
193 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.536872  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3360  NADPH-specific quinone oxidoreductase  64.06 
 
 
193 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.456497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02900  NADPH quinone reductase  64.77 
 
 
193 aa  263  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02850  hypothetical protein  64.77 
 
 
193 aa  263  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3429  NADPH specific quinone oxidoreductase  63.54 
 
 
193 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3770  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.42 
 
 
193 aa  256  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4260  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  62.5 
 
 
193 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000297924 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1179  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  61.86 
 
 
194 aa  255  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.57 
 
 
194 aa  254  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0580  putative NADH-quinone reductase mdaB  59.57 
 
 
194 aa  252  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0277  putative NADH-quinone reductase mdaB  59.57 
 
 
194 aa  252  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1794  MdaB  60.62 
 
 
193 aa  250  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000827251  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1530  flavodoxin-like fold domain-containing protein  59.9 
 
 
192 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1716  flavodoxin-like fold domain-containing protein  59.9 
 
 
192 aa  248  5e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1903  flavodoxin-like fold domain-containing protein  59.9 
 
 
192 aa  246  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0340  putative modulator of drug activity MdaB  51.81 
 
 
193 aa  226  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.796668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.96 
 
 
199 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1618  flavodoxin-like fold domain-containing protein  48.45 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000595904  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.47 
 
 
202 aa  181  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0251  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.72 
 
 
202 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0928314  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4617  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.43 
 
 
201 aa  172  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0982583  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2329  hypothetical protein  45.79 
 
 
193 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2140  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.08 
 
 
194 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1470  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.23 
 
 
207 aa  165  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0965869 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.1 
 
 
197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000325266  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06337  modulator of drug activity B  42.78 
 
 
194 aa  164  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0750  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.36 
 
 
182 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0798  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  40.31 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0747  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.31 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000914606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); modulator of drug activity B  40.31 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.879468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0838  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  40.31 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1023  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  40.31 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0933  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  40.31 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13003e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0931  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  40.84 
 
 
182 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0893  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  40.31 
 
 
182 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4441  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  39.79 
 
 
182 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.488638  normal  0.283336 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1170  NAD(P)H dehydrogenase  37.31 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.29 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1809  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.01 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.664147  normal  0.0637003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.5 
 
 
266 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.12 
 
 
272 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.485932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  33.08 
 
 
263 aa  62  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2561  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.05 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5228  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 
272 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  33.08 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35820  Oxidoreductase  30.64 
 
 
266 aa  59.3  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.89 
 
 
259 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.25 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.07 
 
 
256 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.37 
 
 
249 aa  55.5  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00760  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  29.86 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2368  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.4 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.52 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0969  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.34 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6111  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  27.92 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4021  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.65 
 
 
261 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199607  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20800  NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.86 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689455  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1407  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.4 
 
 
265 aa  52  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1907  general stress protein 14 (GSP14)  27.41 
 
 
186 aa  52  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0155013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3318  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.66 
 
 
237 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  25.58 
 
 
259 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1713  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.03 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0336  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.32 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000026894  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2172  general stress protein 14 (GSP14)  26.35 
 
 
177 aa  51.2  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00000269374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1088  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.83 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1641  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.46 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.21 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.06 
 
 
292 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1300  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.86 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.518586  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.78 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  27.5 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5708  NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.66 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.77 
 
 
259 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4986  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.354623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 
259 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3720  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.405823  normal  0.727928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>