103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0251 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0251  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
202 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0928314  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2140  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  72.02 
 
 
194 aa  296  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1618  flavodoxin-like fold domain-containing protein  59.28 
 
 
199 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000595904  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06337  modulator of drug activity B  54.12 
 
 
194 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.27 
 
 
202 aa  220  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46260  quinone NAD(P)H:oxidoreductase MdaB  51.55 
 
 
194 aa  197  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2329  hypothetical protein  47.42 
 
 
193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3436  NADPH-specific quinone oxidoreductase  51.03 
 
 
193 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.536872  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3429  NADPH specific quinone oxidoreductase  51.03 
 
 
193 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3364  NADPH-specific quinone oxidoreductase  51.03 
 
 
193 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3360  NADPH-specific quinone oxidoreductase  51.03 
 
 
193 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.456497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3531  NADPH-specific quinone oxidoreductase  51.03 
 
 
193 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1179  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.64 
 
 
194 aa  191  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0672  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.74 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3206  modulator of drug activity B  49.74 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3492  modulator of drug activity B  49.74 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0669  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.74 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0139266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3316  modulator of drug activity B  49.74 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.101813 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3461  modulator of drug activity B  49.74 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4336  modulator of drug activity B  49.74 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02900  NADPH quinone reductase  49.74 
 
 
193 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02850  hypothetical protein  49.74 
 
 
193 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3431  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.03 
 
 
193 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3168  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.7 
 
 
195 aa  185  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285135  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0775  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.72 
 
 
196 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.96 
 
 
194 aa  184  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.21 
 
 
196 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.851348 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0580  putative NADH-quinone reductase mdaB  48.96 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0277  putative NADH-quinone reductase mdaB  48.96 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2636  modulator of drug activity B  49.49 
 
 
196 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0718  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.97 
 
 
196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745565  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4523  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.22 
 
 
196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2801  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.91 
 
 
194 aa  181  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151612  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.72 
 
 
223 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30740  putative NADPH specific quinone oxidoreductase  48.22 
 
 
196 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000815222 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1626  modulator of drug activity B  46.07 
 
 
193 aa  176  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4260  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.94 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000297924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0330  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
193 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3770  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
193 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3612  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.88 
 
 
193 aa  168  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
193 aa  168  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0340  putative modulator of drug activity MdaB  39.49 
 
 
193 aa  162  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.796668  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1716  flavodoxin-like fold domain-containing protein  40.72 
 
 
192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1530  flavodoxin-like fold domain-containing protein  40.72 
 
 
192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1903  flavodoxin-like fold domain-containing protein  40.72 
 
 
192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1794  MdaB  40.51 
 
 
193 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000827251  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
197 aa  136  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000325266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0893  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.89 
 
 
182 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4441  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  39.23 
 
 
182 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.488638  normal  0.283336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0798  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  37.37 
 
 
182 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0747  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.37 
 
 
182 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000914606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); modulator of drug activity B  37.37 
 
 
182 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.879468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0838  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  37.37 
 
 
182 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1023  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.37 
 
 
182 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0933  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.37 
 
 
182 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13003e-28 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.73 
 
 
199 aa  127  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0931  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  36.84 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0750  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.79 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1470  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 
207 aa  117  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0965869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4617  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.16 
 
 
201 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0982583  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1170  NAD(P)H dehydrogenase  33.51 
 
 
181 aa  100  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1300  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.518586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  37.01 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
263 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1641  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.11 
 
 
184 aa  58.5  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18170  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  31.14 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.698697  normal  0.941505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.83 
 
 
272 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.485932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.19 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.35 
 
 
256 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4164  quinone reductase  31.1 
 
 
259 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.34 
 
 
266 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5708  NAD(P)H quinone oxidoreductase  26.87 
 
 
238 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.28 
 
 
249 aa  51.6  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.98 
 
 
259 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3377  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65760  NAD(P)H quinone oxidoreductase  25.58 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299621  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0336  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.93 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000026894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3318  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.31 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5228  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.5 
 
 
272 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3214  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.95 
 
 
166 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0544  general stress protein 14 (GSP14)  25.17 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01234  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1878  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.46 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3118  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.47 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00853605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2368  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.45 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0085  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.48 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35820  Oxidoreductase  30.4 
 
 
266 aa  45.1  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  26.5 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1348  putative NAD(P)H oxidoreductase  27.33 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0724701  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2187  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  25.93 
 
 
233 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3978  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.13 
 
 
259 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00187399  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3720  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.2 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.405823  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2044  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.2 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  32.28 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0969  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.12 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3097  putative NAD(P)H oxidoreductase (NAD(P)H dehydrogenase (quinone)) oxidoreductase protein  27.59 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1907  general stress protein 14 (GSP14)  23.88 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0155013  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.1 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1356  general stress protein 14  20.92 
 
 
174 aa  42.4  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1809  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25 
 
 
185 aa  42  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.664147  normal  0.0637003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1820  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  23.7 
 
 
178 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.11224 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>