148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0208 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1618  flavodoxin-like fold domain-containing protein  57.73 
 
 
199 aa  242  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000595904  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06337  modulator of drug activity B  51.55 
 
 
194 aa  231  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2140  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.89 
 
 
194 aa  224  6e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2329  hypothetical protein  54.64 
 
 
193 aa  220  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0251  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.27 
 
 
202 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0928314  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1179  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.98 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.67 
 
 
193 aa  184  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.84 
 
 
194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173692  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46260  quinone NAD(P)H:oxidoreductase MdaB  48.21 
 
 
194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0330  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.15 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0580  putative NADH-quinone reductase mdaB  46.84 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0277  putative NADH-quinone reductase mdaB  46.84 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.98 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.851348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3612  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.67 
 
 
193 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4523  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.47 
 
 
196 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.47 
 
 
223 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2801  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.18 
 
 
194 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30740  putative NADPH specific quinone oxidoreductase  47.21 
 
 
196 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000815222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3770  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.64 
 
 
193 aa  176  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0718  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.64 
 
 
196 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745565  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0775  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.46 
 
 
196 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2636  modulator of drug activity B  45.69 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3168  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.67 
 
 
195 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285135  normal  0.109355 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0672  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.13 
 
 
193 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0340  putative modulator of drug activity MdaB  42.05 
 
 
193 aa  169  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.796668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4336  modulator of drug activity B  45.13 
 
 
193 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3206  modulator of drug activity B  45.13 
 
 
193 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3492  modulator of drug activity B  45.13 
 
 
193 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3461  modulator of drug activity B  45.13 
 
 
193 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0669  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.13 
 
 
193 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0139266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3316  modulator of drug activity B  45.13 
 
 
193 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.101813 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02900  NADPH quinone reductase  44.62 
 
 
193 aa  167  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02850  hypothetical protein  44.62 
 
 
193 aa  167  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1626  modulator of drug activity B  44.27 
 
 
193 aa  167  8e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3531  NADPH-specific quinone oxidoreductase  44.1 
 
 
193 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3360  NADPH-specific quinone oxidoreductase  44.1 
 
 
193 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.456497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3364  NADPH-specific quinone oxidoreductase  44.1 
 
 
193 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3436  NADPH-specific quinone oxidoreductase  44.1 
 
 
193 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.536872  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3429  NADPH specific quinone oxidoreductase  44.1 
 
 
193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3431  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.08 
 
 
193 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4260  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
193 aa  161  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000297924 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1716  flavodoxin-like fold domain-containing protein  43.3 
 
 
192 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1530  flavodoxin-like fold domain-containing protein  43.3 
 
 
192 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1903  flavodoxin-like fold domain-containing protein  43.3 
 
 
192 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1794  MdaB  40.51 
 
 
193 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000827251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 
199 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0798  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  40.41 
 
 
182 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0933  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  40.41 
 
 
182 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13003e-28 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0747  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.41 
 
 
182 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000914606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); modulator of drug activity B  40.41 
 
 
182 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.879468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0838  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  40.41 
 
 
182 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1023  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  40.41 
 
 
182 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0893  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  40.41 
 
 
182 aa  144  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0931  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  40.41 
 
 
182 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.76 
 
 
197 aa  142  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000325266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0750  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.38 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4441  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  39.9 
 
 
182 aa  138  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.488638  normal  0.283336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1470  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.63 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0965869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4617  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36 
 
 
201 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0982583  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1170  NAD(P)H dehydrogenase  37.95 
 
 
181 aa  125  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6111  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  29.41 
 
 
262 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4021  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  25.68 
 
 
261 aa  61.6  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199607  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1713  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.7 
 
 
268 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.5 
 
 
263 aa  58.2  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.61 
 
 
266 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.47 
 
 
266 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.32 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4017  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.63 
 
 
258 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117199  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3903  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.63 
 
 
258 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.96153 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1356  general stress protein 14  25.29 
 
 
174 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.25 
 
 
222 aa  55.1  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3318  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.1 
 
 
237 aa  55.1  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3720  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.99 
 
 
235 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.405823  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5228  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.36 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1893  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.57 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58124  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1711  quinone reductase  28.57 
 
 
290 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
292 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65760  NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.33 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299621  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0903  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.57 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.57 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.693608  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0261  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.57 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2166  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.57 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7083  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.42 
 
 
265 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1407  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.29 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0353  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.57 
 
 
258 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2187  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.91 
 
 
233 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2044  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.91 
 
 
235 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20800  NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.25 
 
 
265 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2561  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.02 
 
 
259 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5708  NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.11 
 
 
238 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  23.79 
 
 
258 aa  52  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1641  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.11 
 
 
184 aa  51.6  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2332  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.15 
 
 
262 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.12 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.08 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4596  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.03 
 
 
259 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.26 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3767  hypothetical protein  28.03 
 
 
259 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.241129  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.12 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.485932 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>