147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6756 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
199 aa  414  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4617  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  61.39 
 
 
201 aa  267  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0982583  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1470  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.2 
 
 
207 aa  263  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0965869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4523  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.47 
 
 
196 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.96 
 
 
223 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0718  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.18 
 
 
196 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745565  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.15 
 
 
196 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.851348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3168  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.64 
 
 
195 aa  190  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285135  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1626  modulator of drug activity B  48.19 
 
 
193 aa  190  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0775  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.67 
 
 
196 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1179  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.19 
 
 
194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0580  putative NADH-quinone reductase mdaB  45.64 
 
 
194 aa  186  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0277  putative NADH-quinone reductase mdaB  45.64 
 
 
194 aa  186  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0330  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
193 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3612  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.9 
 
 
193 aa  185  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.13 
 
 
194 aa  185  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30740  putative NADPH specific quinone oxidoreductase  44.1 
 
 
196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000815222 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.84 
 
 
193 aa  181  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3531  NADPH-specific quinone oxidoreductase  44.39 
 
 
193 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3360  NADPH-specific quinone oxidoreductase  44.39 
 
 
193 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.456497  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3436  NADPH-specific quinone oxidoreductase  44.39 
 
 
193 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.536872  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3364  NADPH-specific quinone oxidoreductase  44.39 
 
 
193 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46260  quinone NAD(P)H:oxidoreductase MdaB  45.88 
 
 
194 aa  180  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0672  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
193 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4336  modulator of drug activity B  44.62 
 
 
193 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2636  modulator of drug activity B  44.16 
 
 
196 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3206  modulator of drug activity B  44.62 
 
 
193 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3492  modulator of drug activity B  44.62 
 
 
193 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0669  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
193 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0139266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3316  modulator of drug activity B  44.62 
 
 
193 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.101813 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3461  modulator of drug activity B  44.62 
 
 
193 aa  179  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3429  NADPH specific quinone oxidoreductase  44.39 
 
 
193 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3431  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
193 aa  178  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02900  NADPH quinone reductase  44.62 
 
 
193 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3770  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.84 
 
 
193 aa  178  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02850  hypothetical protein  44.62 
 
 
193 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2801  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.39 
 
 
194 aa  175  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4260  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.39 
 
 
193 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000297924 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1716  flavodoxin-like fold domain-containing protein  42.05 
 
 
192 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1530  flavodoxin-like fold domain-containing protein  42.05 
 
 
192 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0340  putative modulator of drug activity MdaB  38.97 
 
 
193 aa  159  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.796668  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1903  flavodoxin-like fold domain-containing protein  42.05 
 
 
192 aa  158  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1794  MdaB  40 
 
 
193 aa  151  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000827251  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 
202 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0750  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.72 
 
 
182 aa  141  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4441  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  40.72 
 
 
182 aa  141  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.488638  normal  0.283336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0931  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  40.21 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1618  flavodoxin-like fold domain-containing protein  37.56 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000595904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0798  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  39.69 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0747  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.69 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000914606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); modulator of drug activity B  39.69 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.879468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0838  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  39.69 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1023  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  39.69 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0933  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  39.69 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13003e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0893  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  39.69 
 
 
182 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06337  modulator of drug activity B  36.73 
 
 
194 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2329  hypothetical protein  37.44 
 
 
193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0251  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.73 
 
 
202 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0928314  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2140  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.31 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.72 
 
 
197 aa  121  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000325266  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1170  NAD(P)H dehydrogenase  32.65 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.52 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5228  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  35.06 
 
 
272 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6111  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  29.84 
 
 
262 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.91 
 
 
263 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  31.16 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4986  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.29 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.354623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.1 
 
 
256 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.03 
 
 
263 aa  55.1  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 
266 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20800  NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.91 
 
 
265 aa  54.7  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689455  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.17 
 
 
259 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4021  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
261 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199607  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3642  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  35.06 
 
 
261 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750916  normal  0.729686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1407  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.89 
 
 
265 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5496  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.06 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.993327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.06 
 
 
259 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0470076  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4596  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.06 
 
 
259 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3767  hypothetical protein  35.06 
 
 
259 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.241129  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  34.57 
 
 
258 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.59 
 
 
259 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0353  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.71 
 
 
258 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4164  quinone reductase  29.52 
 
 
259 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1893  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.71 
 
 
258 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35820  Oxidoreductase  33.71 
 
 
266 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0903  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.71 
 
 
258 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.71 
 
 
258 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.693608  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0261  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.71 
 
 
258 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2166  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.71 
 
 
258 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7083  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.47 
 
 
292 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.47 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333556 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1711  quinone reductase  27.71 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3720  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.88 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.405823  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.07 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.45 
 
 
249 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2044  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.16 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 
259 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2187  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.88 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1088  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.17 
 
 
261 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  22.82 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>