141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1618 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1618  flavodoxin-like fold domain-containing protein  100 
 
 
199 aa  421  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000595904  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0251  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.28 
 
 
202 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0928314  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2140  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  61.46 
 
 
194 aa  254  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.73 
 
 
202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06337  modulator of drug activity B  55.15 
 
 
194 aa  232  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2329  hypothetical protein  53.09 
 
 
193 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1179  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.48 
 
 
194 aa  195  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2801  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.6 
 
 
194 aa  192  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151612  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0580  putative NADH-quinone reductase mdaB  47.89 
 
 
194 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0277  putative NADH-quinone reductase mdaB  47.89 
 
 
194 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.89 
 
 
194 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3168  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.45 
 
 
195 aa  187  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285135  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0775  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.48 
 
 
196 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46260  quinone NAD(P)H:oxidoreductase MdaB  45.83 
 
 
194 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.97 
 
 
196 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.851348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3612  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.97 
 
 
193 aa  185  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4523  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.97 
 
 
196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3770  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.91 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0330  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.85 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.45 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1903  flavodoxin-like fold domain-containing protein  47.42 
 
 
192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4260  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.94 
 
 
193 aa  181  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000297924 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1716  flavodoxin-like fold domain-containing protein  47.42 
 
 
192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.36 
 
 
193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0718  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.42 
 
 
196 aa  181  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745565  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1530  flavodoxin-like fold domain-containing protein  47.42 
 
 
192 aa  181  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2636  modulator of drug activity B  48.42 
 
 
196 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30740  putative NADPH specific quinone oxidoreductase  45.88 
 
 
196 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000815222 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0672  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.72 
 
 
193 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3206  modulator of drug activity B  47.72 
 
 
193 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3492  modulator of drug activity B  47.72 
 
 
193 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4336  modulator of drug activity B  47.72 
 
 
193 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0669  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.72 
 
 
193 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0139266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3316  modulator of drug activity B  47.72 
 
 
193 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.101813 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3461  modulator of drug activity B  47.72 
 
 
193 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02900  NADPH quinone reductase  47.21 
 
 
193 aa  174  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02850  hypothetical protein  47.21 
 
 
193 aa  174  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1626  modulator of drug activity B  44.56 
 
 
193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165917  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0340  putative modulator of drug activity MdaB  43.3 
 
 
193 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.796668  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3360  NADPH-specific quinone oxidoreductase  46.19 
 
 
193 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.456497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3531  NADPH-specific quinone oxidoreductase  46.19 
 
 
193 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3436  NADPH-specific quinone oxidoreductase  46.19 
 
 
193 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.536872  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3364  NADPH-specific quinone oxidoreductase  46.19 
 
 
193 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3431  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.69 
 
 
193 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3429  NADPH specific quinone oxidoreductase  46.19 
 
 
193 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1794  MdaB  42.78 
 
 
193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000827251  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.05 
 
 
197 aa  155  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000325266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0750  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.84 
 
 
182 aa  144  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0798  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  39.09 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0747  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.09 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000914606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); modulator of drug activity B  39.09 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.879468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0838  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  39.09 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1023  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  39.09 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0933  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  39.09 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13003e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0931  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  39.09 
 
 
182 aa  143  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0893  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  39.09 
 
 
182 aa  141  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4441  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  38.58 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.488638  normal  0.283336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.56 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1470  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.31 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0965869 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1170  NAD(P)H dehydrogenase  38.66 
 
 
181 aa  132  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4617  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.13 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0982583  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.23 
 
 
263 aa  62  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.57 
 
 
200 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.68 
 
 
263 aa  59.3  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6111  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  31.93 
 
 
262 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.64 
 
 
272 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.485932 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18170  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  30.54 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.698697  normal  0.941505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.22 
 
 
249 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.09 
 
 
259 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2561  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.08 
 
 
259 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4164  quinone reductase  26.09 
 
 
259 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1893  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.09 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58124  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1711  quinone reductase  26.09 
 
 
290 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0903  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.09 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.09 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.693608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0353  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.09 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0261  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.09 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2166  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.09 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7083  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1300  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25 
 
 
180 aa  53.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.518586  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2429  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.71 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.391574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.05 
 
 
258 aa  52  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35820  Oxidoreductase  32.52 
 
 
266 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2368  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.01 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1641  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.01 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.08 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.65 
 
 
256 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4021  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  25.49 
 
 
261 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199607  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00050  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein  25.95 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3553  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.95 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00049  hypothetical protein  25.95 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5496  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.43 
 
 
261 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.993327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0052  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  25.95 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0050  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  25.95 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  24.76 
 
 
259 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0048  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  25.95 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.83 
 
 
259 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3097  putative NAD(P)H oxidoreductase (NAD(P)H dehydrogenase (quinone)) oxidoreductase protein  28.15 
 
 
182 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.47 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0050  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  25.95 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3642  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  25.24 
 
 
261 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750916  normal  0.729686 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>