171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3316 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02900  NADPH quinone reductase  99.48 
 
 
193 aa  400  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0672  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3461  modulator of drug activity B  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4336  modulator of drug activity B  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3316  modulator of drug activity B  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.101813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3206  modulator of drug activity B  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3492  modulator of drug activity B  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02850  hypothetical protein  99.48 
 
 
193 aa  400  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0669  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0139266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3436  NADPH-specific quinone oxidoreductase  92.23 
 
 
193 aa  376  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.536872  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3531  NADPH-specific quinone oxidoreductase  92.23 
 
 
193 aa  376  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3364  NADPH-specific quinone oxidoreductase  92.23 
 
 
193 aa  376  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3360  NADPH-specific quinone oxidoreductase  92.23 
 
 
193 aa  376  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.456497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3429  NADPH specific quinone oxidoreductase  91.71 
 
 
193 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3431  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  84.46 
 
 
193 aa  355  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0330  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  70.47 
 
 
193 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  71.5 
 
 
193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4260  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  70.47 
 
 
193 aa  290  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000297924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3612  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  68.91 
 
 
193 aa  290  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0580  putative NADH-quinone reductase mdaB  67.89 
 
 
194 aa  285  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0277  putative NADH-quinone reductase mdaB  67.89 
 
 
194 aa  285  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  67.37 
 
 
194 aa  282  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173692  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2801  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  66.67 
 
 
194 aa  281  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3770  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  65.8 
 
 
193 aa  276  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3168  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  64.25 
 
 
195 aa  272  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285135  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0775  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  66.32 
 
 
196 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46260  quinone NAD(P)H:oxidoreductase MdaB  64.74 
 
 
194 aa  270  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1179  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  63.73 
 
 
194 aa  269  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30740  putative NADPH specific quinone oxidoreductase  64.77 
 
 
196 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000815222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4523  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  66.32 
 
 
196 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  65.28 
 
 
196 aa  267  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.851348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  65.28 
 
 
223 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2636  modulator of drug activity B  65.8 
 
 
196 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0718  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  62.69 
 
 
196 aa  261  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745565  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1626  modulator of drug activity B  60.85 
 
 
193 aa  257  7e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165917  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1794  MdaB  60.62 
 
 
193 aa  250  8.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000827251  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1716  flavodoxin-like fold domain-containing protein  57.81 
 
 
192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1530  flavodoxin-like fold domain-containing protein  57.81 
 
 
192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0340  putative modulator of drug activity MdaB  53.37 
 
 
193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.796668  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1903  flavodoxin-like fold domain-containing protein  57.29 
 
 
192 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0251  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.74 
 
 
202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0928314  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2140  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.15 
 
 
194 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
199 aa  179  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1618  flavodoxin-like fold domain-containing protein  47.72 
 
 
199 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000595904  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4617  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.94 
 
 
201 aa  171  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0982583  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.13 
 
 
202 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06337  modulator of drug activity B  43.81 
 
 
194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000325266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1470  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.92 
 
 
207 aa  158  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0965869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2329  hypothetical protein  43.3 
 
 
193 aa  150  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0750  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.74 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1023  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.7 
 
 
182 aa  141  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0798  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  37.7 
 
 
182 aa  141  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0747  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 
182 aa  141  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000914606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); modulator of drug activity B  37.7 
 
 
182 aa  141  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.879468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0838  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  37.7 
 
 
182 aa  141  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727783  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0933  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.7 
 
 
182 aa  141  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13003e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4441  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.7 
 
 
182 aa  141  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.488638  normal  0.283336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0893  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.77 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0931  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  37.77 
 
 
182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1170  NAD(P)H dehydrogenase  36.27 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.58 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1809  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.06 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.664147  normal  0.0637003 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1300  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.7 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.518586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.63 
 
 
263 aa  64.7  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.03 
 
 
263 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.45 
 
 
272 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.485932 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18170  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  29.19 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.698697  normal  0.941505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.71 
 
 
259 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6111  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  31.78 
 
 
262 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5228  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.71 
 
 
272 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1641  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.31 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2561  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.13 
 
 
259 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00760  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  31.43 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.15 
 
 
222 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4986  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.47 
 
 
222 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.354623 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0336  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.29 
 
 
201 aa  58.2  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000026894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.37 
 
 
256 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0969  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.16 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.416536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1878  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.65 
 
 
266 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.54 
 
 
249 aa  55.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1407  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.42 
 
 
265 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2172  general stress protein 14 (GSP14)  26.84 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00000269374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.73 
 
 
259 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.43 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.91 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.43 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  26.43 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.33 
 
 
259 aa  55.1  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  29.91 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3118  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.75 
 
 
177 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00853605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  24.29 
 
 
193 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  24.29 
 
 
193 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1713  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.61 
 
 
268 aa  54.7  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1356  general stress protein 14  25.73 
 
 
174 aa  54.7  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3318  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.32 
 
 
237 aa  54.7  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5708  NAD(P)H quinone oxidoreductase  26.32 
 
 
238 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.91 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2187  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.28 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>