170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0322 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
193 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0330  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  93.78 
 
 
193 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3612  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  81.87 
 
 
193 aa  337  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3770  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  74.61 
 
 
193 aa  315  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0580  putative NADH-quinone reductase mdaB  74.74 
 
 
194 aa  313  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0277  putative NADH-quinone reductase mdaB  74.74 
 
 
194 aa  313  7e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3431  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  73.06 
 
 
193 aa  309  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  73.68 
 
 
194 aa  308  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0672  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  71.5 
 
 
193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3531  NADPH-specific quinone oxidoreductase  70.47 
 
 
193 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3436  NADPH-specific quinone oxidoreductase  70.47 
 
 
193 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.536872  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3364  NADPH-specific quinone oxidoreductase  70.47 
 
 
193 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3461  modulator of drug activity B  71.5 
 
 
193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3316  modulator of drug activity B  71.5 
 
 
193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.101813 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0669  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  71.5 
 
 
193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0139266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3206  modulator of drug activity B  71.5 
 
 
193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3492  modulator of drug activity B  71.5 
 
 
193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4336  modulator of drug activity B  71.5 
 
 
193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3360  NADPH-specific quinone oxidoreductase  70.47 
 
 
193 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.456497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3429  NADPH specific quinone oxidoreductase  70.47 
 
 
193 aa  305  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02900  NADPH quinone reductase  70.98 
 
 
193 aa  304  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02850  hypothetical protein  70.98 
 
 
193 aa  304  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4260  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  74.09 
 
 
193 aa  302  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000297924 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3168  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  62.18 
 
 
195 aa  279  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285135  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4523  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  64.77 
 
 
196 aa  277  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4661  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  64.06 
 
 
223 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0775  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  63.54 
 
 
196 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30740  putative NADPH specific quinone oxidoreductase  63.21 
 
 
196 aa  275  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000815222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  64.25 
 
 
196 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.851348 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2801  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  64.92 
 
 
194 aa  275  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2636  modulator of drug activity B  63.73 
 
 
196 aa  271  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0718  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  62.69 
 
 
196 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745565  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1179  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.62 
 
 
194 aa  261  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46260  quinone NAD(P)H:oxidoreductase MdaB  62.3 
 
 
194 aa  259  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1626  modulator of drug activity B  60.53 
 
 
193 aa  258  5.0000000000000005e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165917  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1794  MdaB  59.59 
 
 
193 aa  257  7e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000827251  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1530  flavodoxin-like fold domain-containing protein  55.21 
 
 
192 aa  229  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1716  flavodoxin-like fold domain-containing protein  55.21 
 
 
192 aa  229  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0340  putative modulator of drug activity MdaB  50.78 
 
 
193 aa  228  4e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.796668  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1903  flavodoxin-like fold domain-containing protein  55.21 
 
 
192 aa  228  5e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.67 
 
 
202 aa  184  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1618  flavodoxin-like fold domain-containing protein  45.36 
 
 
199 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000595904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.84 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2140  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.11 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4617  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.42 
 
 
201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0982583  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06337  modulator of drug activity B  43.3 
 
 
194 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0251  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
202 aa  168  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0928314  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1470  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.72 
 
 
207 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0965869 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000325266  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2329  hypothetical protein  43.3 
 
 
193 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0931  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  38.1 
 
 
182 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0798  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  37.7 
 
 
182 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0747  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 
182 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000914606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); modulator of drug activity B  37.7 
 
 
182 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.879468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1023  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.7 
 
 
182 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0838  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  37.7 
 
 
182 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727783  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0933  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.7 
 
 
182 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13003e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0750  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 
182 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0893  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.57 
 
 
182 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4441  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.17 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.488638  normal  0.283336 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1170  NAD(P)H dehydrogenase  39.18 
 
 
181 aa  124  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2561  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.31 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.96 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4986  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.51 
 
 
222 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.354623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 
263 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.29 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.97 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.57 
 
 
193 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.57 
 
 
193 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.64 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1809  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.81 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.664147  normal  0.0637003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.14 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.86 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  33.64 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  27.86 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  27.86 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.82 
 
 
263 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  27.14 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.86 
 
 
266 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.86 
 
 
193 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.13 
 
 
272 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.485932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.1 
 
 
259 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.06 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6111  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  27.05 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5228  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.42 
 
 
272 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.21 
 
 
266 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2044  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 
235 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1713  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.69 
 
 
268 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3720  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 
235 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.405823  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.16 
 
 
292 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3318  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.82 
 
 
237 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35820  Oxidoreductase  27.91 
 
 
266 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1407  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.17 
 
 
265 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
249 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4021  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.58 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199607  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2187  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 
233 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.07 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1300  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.24 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.518586  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00760  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  29.58 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.01 
 
 
256 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>