22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1573 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1573  major tail protein, putative  100 
 
 		 244 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4107  hypothetical protein  88.52 
 
 		 244 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08210  hypothetical protein  60.53 
 
 		 164 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.360932  hitchhiker  0.0000533826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0777  hypothetical protein  60.53 
 
 		 164 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1345  hypothetical protein  62.28 
 
 		 165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2956  prophage LambdaSo, major tail protein V, putative  40 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  53.41 
 
 		 603 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2586  prophage LambdaSo, major tail protein V, putative  39.09 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.730482 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3758  hypothetical protein  50 
 
 		 1074 aa  58.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207079  normal  0.135364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  50.79 
 
 		 1973 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2752  hypothetical protein  44.05 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3600  beta-lactamase  48.68 
 
 		 584 aa  55.1  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  50 
 
 		 474 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2527  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.95 
 
 		 847 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  56.1 
 
 		 1066 aa  52  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2690  secreted hydrolase-like protein  50.82 
 
 		 442 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2137  hypothetical protein  34.51 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.534217  normal  0.49056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  44.3 
 
 		 476 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  43.24 
 
 		 626 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0241  hypothetical protein  44.86 
 
 		 810 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  40.98 
 
 		 613 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3389  hypothetical protein  30.51 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000807621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>