11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0241 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0241  hypothetical protein  100 
 
 		 810 aa  1615    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  45.74 
 
 		 603 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4107  hypothetical protein  47.06 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3758  hypothetical protein  52.31 
 
 		 1074 aa  57.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207079  normal  0.135364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2752  hypothetical protein  40.54 
 
 		 288 aa  55.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2137  hypothetical protein  46.43 
 
 		 308 aa  50.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.534217  normal  0.49056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  43.62 
 
 		 1973 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  41.84 
 
 		 626 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1573  major tail protein, putative  45.1 
 
 		 244 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039923 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  52.94 
 
 		 618 aa  47.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  52.83 
 
 		 613 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>