58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78316 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_78316  Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2, mitochondrial precursor  100 
 
 		 371 aa  734    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.217097  normal  0.408793 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04470  ubiquinol-cytochrome C reductase complex core protein 2 precursor, putative  32.91 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08273  Ubiquinol-cytochrome c reductase complex core protein 2 (Eurofung)  28.92 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.666909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0269  peptidase M16 domain protein  23.38 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  23.31 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_51888  predicted protein  25.94 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0830441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3449  processing peptidase  23.1 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3253  processing peptidase  23.1 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3577  processing peptidase  23.1 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  26.44 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1589  processing peptidase  21.97 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0398438 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  24.04 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36688  mitochondrial processing protease  23.24 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0178117  normal  0.476468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  21.43 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  25.12 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  26.22 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29535  predicted protein  24.69 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00887655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  19.54 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0759  peptidase M16-like  24.42 
 
 		 430 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0235  M16 family peptidase  23.3 
 
 		 421 aa  53.9  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04620  mitochondrial processing peptidase, putative  24.77 
 
 		 526 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261282  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3525  peptidase M16 domain-containing protein  22.47 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.855558  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00860  mitochondrial processing peptidase beta subunit, mitochondrial precursor (beta-mpp), putative  23.01 
 
 		 477 aa  53.1  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0244089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  23.96 
 
 		 504 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  25.67 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  23.04 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  26.63 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49260  Mitochondrial processing peptidase alpha subunit, mitochondrial precursor (Alpha-MPP)  21.21 
 
 		 496 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0300879  normal  0.382382 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0488  zinc protease  22.33 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0964093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0598  processing peptidase  22.82 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  22.33 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  27.61 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0263  peptidase M16-like  25.61 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.736782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  25.67 
 
 		 429 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  28.12 
 
 		 421 aa  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0309  processing peptidase  29.03 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  24.19 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  25.26 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  29.79 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  25.45 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0634  peptidase M16 domain protein  22.47 
 
 		 432 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  24.54 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  24.62 
 
 		 434 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  22.88 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.257658 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01104  mitochondrial processing peptidase alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11870)  22.54 
 
 		 570 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.699873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0621  processing peptidase  19.26 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08061  Zn-dependent peptidase  22.02 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  24.58 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20787  predicted protein  21.29 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0430146  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1832  M16 family peptidase  23.89 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  23.01 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0175  M16 family peptidase  21.46 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  23.78 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0411  M16 family peptidase  21.74 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.887609  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  30.26 
 
 		 421 aa  43.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  23.67 
 
 		 878 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1252  peptidase M16 domain protein  24.7 
 
 		 421 aa  43.1  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  22.57 
 
 		 840 aa  42.7  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>