18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_76461 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_76461  predicted protein  100 
 
 
442 aa  913    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08795  hypothetical protein similar to clathrin associated protein AP47 (Broad)  57.4 
 
 
446 aa  538  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.428782  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02610  clathrin assembly protein AP47, putative  57.82 
 
 
435 aa  523  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54375  predicted protein  51.11 
 
 
439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.907036  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119564  clathrin adaptor medium subunit, putative  37.01 
 
 
433 aa  310  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307653  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01890  intracellular protein transport-related protein, putative  34.45 
 
 
428 aa  292  9e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.397687  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07741  AP-2 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07930)  34.33 
 
 
454 aa  290  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18142  predicted protein  34.38 
 
 
425 aa  281  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40743  predicted protein  33.7 
 
 
478 aa  274  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0562331 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60950  predicted protein  31.04 
 
 
465 aa  232  9e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45284  predicted protein  33.97 
 
 
470 aa  230  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000814146  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13352  predicted protein  26.27 
 
 
481 aa  176  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.585988 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18241  predicted protein  29.12 
 
 
416 aa  170  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50277  predicted protein  28.16 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0969699  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42610  predicted protein  26.63 
 
 
660 aa  144  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.355698 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03670  adaptor complex subunit medium chain 3, putative  28.05 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300956  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05641  AP-3 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13490)  27.31 
 
 
636 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00922  Coatomer subunit delta, putative (Eurofung)  24.24 
 
 
516 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.452346  normal  0.181778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>