17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18142 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_18142  predicted protein  100 
 
 		 425 aa  887    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07741  AP-2 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07930)  46.44 
 
 		 454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01890  intracellular protein transport-related protein, putative  47.92 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.397687  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40743  predicted protein  40.27 
 
 		 478 aa  353  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0562331 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02610  clathrin assembly protein AP47, putative  40.52 
 
 		 435 aa  338  8e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08795  hypothetical protein similar to clathrin associated protein AP47 (Broad)  37.72 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.428782  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60950  predicted protein  33.97 
 
 		 465 aa  316  5e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54375  predicted protein  37.64 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.907036  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76461  predicted protein  34.38 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45284  predicted protein  32.07 
 
 		 470 aa  245  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000814146  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119564  clathrin adaptor medium subunit, putative  31 
 
 		 433 aa  236  7e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307653  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13352  predicted protein  29.42 
 
 		 481 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.585988 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18241  predicted protein  26.79 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50277  predicted protein  25.83 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0969699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03670  adaptor complex subunit medium chain 3, putative  24.37 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300956  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05641  AP-3 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13490)  27.39 
 
 		 636 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42610  predicted protein  24.26 
 
 		 660 aa  93.6  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.355698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>