15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42610 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_42610  predicted protein  100 
 
 		 660 aa  1366    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.355698 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08795  hypothetical protein similar to clathrin associated protein AP47 (Broad)  25.86 
 
 		 446 aa  190  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.428782  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76461  predicted protein  26.11 
 
 		 442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02610  clathrin assembly protein AP47, putative  25 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07741  AP-2 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07930)  21.86 
 
 		 454 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54375  predicted protein  24.21 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.907036  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01890  intracellular protein transport-related protein, putative  22.13 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.397687  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119564  clathrin adaptor medium subunit, putative  25 
 
 		 433 aa  118  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307653  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18142  predicted protein  22.44 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60950  predicted protein  20.95 
 
 		 465 aa  101  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40743  predicted protein  22.52 
 
 		 478 aa  87.4  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0562331 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45284  predicted protein  20.21 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000814146  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18241  predicted protein  25.29 
 
 		 416 aa  55.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13352  predicted protein  23.76 
 
 		 481 aa  51.6  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.585988 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50277  predicted protein  41.51 
 
 		 424 aa  43.9  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0969699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>