17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01890 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB01890  intracellular protein transport-related protein, putative  100 
 
 		 428 aa  883    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.397687  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07741  AP-2 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07930)  62.72 
 
 		 454 aa  586  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18142  predicted protein  47.92 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60950  predicted protein  41.24 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40743  predicted protein  41.11 
 
 		 478 aa  355  8.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0562331 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02610  clathrin assembly protein AP47, putative  39.77 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54375  predicted protein  40.95 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.907036  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08795  hypothetical protein similar to clathrin associated protein AP47 (Broad)  39.16 
 
 		 446 aa  331  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.428782  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76461  predicted protein  34.45 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119564  clathrin adaptor medium subunit, putative  32.57 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307653  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45284  predicted protein  30.48 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000814146  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13352  predicted protein  26.28 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.585988 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18241  predicted protein  28.77 
 
 		 416 aa  189  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50277  predicted protein  25.28 
 
 		 424 aa  133  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0969699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03670  adaptor complex subunit medium chain 3, putative  25.25 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300956  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05641  AP-3 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13490)  25.42 
 
 		 636 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42610  predicted protein  22.98 
 
 		 660 aa  91.3  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.355698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>