17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40743 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009369  OSTLU_40743  predicted protein  100 
 
 
478 aa  990    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0562331 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07741  AP-2 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07930)  41.05 
 
 
454 aa  375  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01890  intracellular protein transport-related protein, putative  41.13 
 
 
428 aa  361  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.397687  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18142  predicted protein  40.3 
 
 
425 aa  359  6e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60950  predicted protein  32.52 
 
 
465 aa  291  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02610  clathrin assembly protein AP47, putative  35.1 
 
 
435 aa  287  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08795  hypothetical protein similar to clathrin associated protein AP47 (Broad)  33.97 
 
 
446 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.428782  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54375  predicted protein  34.03 
 
 
439 aa  280  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.907036  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76461  predicted protein  33.77 
 
 
442 aa  276  6e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119564  clathrin adaptor medium subunit, putative  28.79 
 
 
433 aa  219  8.999999999999998e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307653  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45284  predicted protein  30.52 
 
 
470 aa  210  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000814146  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13352  predicted protein  26.85 
 
 
481 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.585988 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18241  predicted protein  27.27 
 
 
416 aa  156  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03670  adaptor complex subunit medium chain 3, putative  25.32 
 
 
454 aa  124  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300956  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50277  predicted protein  24.25 
 
 
424 aa  116  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0969699  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05641  AP-3 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13490)  27.17 
 
 
636 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42610  predicted protein  21.43 
 
 
660 aa  85.9  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.355698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>