19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG02610 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_08795  hypothetical protein similar to clathrin associated protein AP47 (Broad)  73.91 
 
 		 446 aa  672    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.428782  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02610  clathrin assembly protein AP47, putative  100 
 
 		 435 aa  895    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54375  predicted protein  62.1 
 
 		 439 aa  551  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.907036  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76461  predicted protein  57.82 
 
 		 442 aa  514  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01890  intracellular protein transport-related protein, putative  39.77 
 
 		 428 aa  346  5e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.397687  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119564  clathrin adaptor medium subunit, putative  40.38 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307653  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07741  AP-2 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07930)  39.55 
 
 		 454 aa  340  4e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18142  predicted protein  40.52 
 
 		 425 aa  338  8e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40743  predicted protein  35.03 
 
 		 478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0562331 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60950  predicted protein  30.59 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45284  predicted protein  33.75 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000814146  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18241  predicted protein  30.56 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13352  predicted protein  28.36 
 
 		 481 aa  203  5e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.585988 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42610  predicted protein  25.16 
 
 		 660 aa  175  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.355698 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50277  predicted protein  26.56 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0969699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03670  adaptor complex subunit medium chain 3, putative  30.8 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300956  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05641  AP-3 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13490)  28.86 
 
 		 636 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90035  predicted protein  23.36 
 
 		 551 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.440563  normal  0.473426 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00922  Coatomer subunit delta, putative (Eurofung)  23.88 
 
 		 516 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.452346  normal  0.181778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>