17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_50277 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009362  OSTLU_50277  predicted protein  100 
 
 		 424 aa  870    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0969699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18241  predicted protein  32.55 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03670  adaptor complex subunit medium chain 3, putative  29.46 
 
 		 454 aa  183  6e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300956  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18142  predicted protein  25.83 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76461  predicted protein  28.16 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02610  clathrin assembly protein AP47, putative  26.56 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01890  intracellular protein transport-related protein, putative  25.28 
 
 		 428 aa  133  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.397687  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08795  hypothetical protein similar to clathrin associated protein AP47 (Broad)  24.13 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.428782  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54375  predicted protein  23.35 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.907036  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07741  AP-2 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07930)  26.59 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45284  predicted protein  25.84 
 
 		 470 aa  123  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000814146  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60950  predicted protein  25.06 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119564  clathrin adaptor medium subunit, putative  24.03 
 
 		 433 aa  113  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307653  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40743  predicted protein  24.03 
 
 		 478 aa  113  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0562331 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05641  AP-3 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13490)  30.57 
 
 		 636 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13352  predicted protein  22.85 
 
 		 481 aa  92.8  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.585988 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42610  predicted protein  41.51 
 
 		 660 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.355698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>