16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03670 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB03670  adaptor complex subunit medium chain 3, putative  100 
 
 		 454 aa  937    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300956  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18241  predicted protein  34.62 
 
 		 416 aa  209  7e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50277  predicted protein  29.46 
 
 		 424 aa  183  6e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0969699  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05641  AP-3 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13490)  32.89 
 
 		 636 aa  149  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18142  predicted protein  24.37 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02610  clathrin assembly protein AP47, putative  30.8 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07741  AP-2 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07930)  25.42 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08795  hypothetical protein similar to clathrin associated protein AP47 (Broad)  30.94 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.428782  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01890  intracellular protein transport-related protein, putative  25.25 
 
 		 428 aa  127  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.397687  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54375  predicted protein  27.4 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.907036  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40743  predicted protein  25.32 
 
 		 478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0562331 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76461  predicted protein  27.46 
 
 		 442 aa  120  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60950  predicted protein  25.18 
 
 		 465 aa  113  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45284  predicted protein  25.64 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000814146  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119564  clathrin adaptor medium subunit, putative  24.54 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307653  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13352  predicted protein  22.22 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.585988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>