18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54375 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_54375  predicted protein  100 
 
 		 439 aa  912    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.907036  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08795  hypothetical protein similar to clathrin associated protein AP47 (Broad)  60.58 
 
 		 446 aa  556  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.428782  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02610  clathrin assembly protein AP47, putative  62.1 
 
 		 435 aa  551  1e-156  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76461  predicted protein  50.88 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119564  clathrin adaptor medium subunit, putative  40.41 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307653  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01890  intracellular protein transport-related protein, putative  40.95 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.397687  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07741  AP-2 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07930)  37.23 
 
 		 454 aa  317  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18142  predicted protein  37.64 
 
 		 425 aa  313  4.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40743  predicted protein  34.27 
 
 		 478 aa  276  7e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0562331 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60950  predicted protein  32.55 
 
 		 465 aa  257  4e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45284  predicted protein  32.99 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000814146  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13352  predicted protein  27.02 
 
 		 481 aa  196  9e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.585988 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18241  predicted protein  27.65 
 
 		 416 aa  183  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50277  predicted protein  23.35 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0969699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03670  adaptor complex subunit medium chain 3, putative  27.4 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300956  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42610  predicted protein  23.68 
 
 		 660 aa  120  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.355698 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05641  AP-3 adaptor complex subunit mu, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13490)  26.17 
 
 		 636 aa  103  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30436  predicted protein  27.2 
 
 		 512 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.937376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>