35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60390 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_60390  triacylglycerol lipase  100 
 
 
313 aa  648    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  31.19 
 
 
404 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  23.29 
 
 
350 aa  67  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  25.14 
 
 
234 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  23.43 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  32.24 
 
 
539 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  30.32 
 
 
357 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  27.27 
 
 
727 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  26.14 
 
 
726 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  23.63 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  27.27 
 
 
299 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  28.66 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  28.66 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  28.66 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  28.66 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  28.66 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  28.66 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  29.27 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  28.05 
 
 
240 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  28.66 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  28.66 
 
 
240 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  29.92 
 
 
258 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46753  predicted protein  33.33 
 
 
405 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00406478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  28.05 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47614  predicted protein  28.57 
 
 
744 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  27.92 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  27.92 
 
 
387 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08743  lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02710)  35.05 
 
 
1152 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.990446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  27.03 
 
 
324 aa  46.2  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01560  lipase-related protein  26.79 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41624  predicted protein  23.81 
 
 
596 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.263212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  25.68 
 
 
641 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0603  lipase, class 3  25.84 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  24.29 
 
 
758 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  26.6 
 
 
384 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>