11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47614 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47614  predicted protein  100 
 
 
744 aa  1541    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44231  predicted protein  28.88 
 
 
814 aa  294  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253188  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28912  predicted protein  29.16 
 
 
699 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.597886  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24393  predicted protein  31.07 
 
 
694 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43463  predicted protein  28.66 
 
 
563 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.117357  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31492  predicted protein  30.43 
 
 
546 aa  56.6  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47445  predicted protein  29.56 
 
 
538 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33194  predicted protein  25.99 
 
 
672 aa  52.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274614 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08743  lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02710)  28.73 
 
 
1152 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.990446 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41624  predicted protein  30.92 
 
 
596 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.263212  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60390  triacylglycerol lipase  27.91 
 
 
313 aa  43.9  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>