13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41624 on replicon NC_011700
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011700  PHATRDRAFT_41624  predicted protein  100 
 
 
596 aa  1242    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.263212  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35081  predicted protein  83.66 
 
 
158 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0258255  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44028  predicted protein  31.09 
 
 
576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566406  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33194  predicted protein  23.19 
 
 
672 aa  67  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274614 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24393  predicted protein  29.12 
 
 
694 aa  64.7  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  25.47 
 
 
539 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47445  predicted protein  22.64 
 
 
538 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31492  predicted protein  31.43 
 
 
546 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  27.27 
 
 
276 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08743  lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02710)  25.7 
 
 
1152 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.990446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  29.22 
 
 
299 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47614  predicted protein  30.92 
 
 
744 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  26.12 
 
 
357 aa  44.3  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>