15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33304 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_33304  predicted protein  100 
 
 		 122 aa  255  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00620413  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35794  predicted protein  68.18 
 
 		 103 aa  134  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03050  pre-mRNA splicing factor, putative  64.13 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.03026  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01802  small nuclear ribonucleoprotein SmD2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12910)  65.82 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60825  predicted protein  47.73 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0777781  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  30 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.29 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43068  predicted protein  27.19 
 
 		 349 aa  45.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.150717  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  33.8 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  33.82 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  32.97 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  31.71 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  31.51 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  31.33 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  29.47 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>