18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03050 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB03050  pre-mRNA splicing factor, putative  100 
 
 		 111 aa  229  9e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.03026  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35794  predicted protein  74 
 
 		 103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01802  small nuclear ribonucleoprotein SmD2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12910)  71.43 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60825  predicted protein  51.35 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0777781  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33304  predicted protein  64.13 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00620413  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  32.93 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  37.5 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  30.49 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_23784  predicted protein  30.38 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0444134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.67 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  35.94 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  28.05 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  30.86 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  30.77 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  30.77 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  26.67 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  30.12 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>