More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7195 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_7195  predicted protein  100 
 
 
160 aa  330  5e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.14 
 
 
160 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.05 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.11 
 
 
166 aa  118  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.22 
 
 
151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.95 
 
 
156 aa  117  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  43.05 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.4 
 
 
152 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0232  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.6 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.85 
 
 
166 aa  115  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.54 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  43.54 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40 
 
 
151 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1856  tRNA-adenosine deaminase  39.75 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.489212  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  42.95 
 
 
183 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.79 
 
 
175 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 
174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.76 
 
 
167 aa  110  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.27 
 
 
156 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.78 
 
 
148 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  38.82 
 
 
152 aa  110  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.27 
 
 
156 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42 
 
 
182 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.25 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  38.41 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.27 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  37.66 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.47 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  40 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.21 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.31 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.36 
 
 
231 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.13 
 
 
170 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.79 
 
 
154 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  37.66 
 
 
149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  39.74 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  42.86 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.82 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.51 
 
 
155 aa  107  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.78 
 
 
147 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  39.49 
 
 
172 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  39.49 
 
 
172 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  38.99 
 
 
172 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  39.49 
 
 
172 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.5 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  39.49 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.4 
 
 
177 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.93 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  41.22 
 
 
144 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
164 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  37.74 
 
 
200 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0231  hypothetical protein  38.93 
 
 
155 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  37.74 
 
 
187 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.83 
 
 
223 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.27 
 
 
176 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  40.14 
 
 
148 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.33 
 
 
164 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.14 
 
 
148 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  42.28 
 
 
168 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  37.75 
 
 
168 aa  105  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  44.85 
 
 
137 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  39.74 
 
 
172 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  38.26 
 
 
177 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.05 
 
 
411 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.07 
 
 
169 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.77 
 
 
165 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.83 
 
 
158 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.82 
 
 
150 aa  104  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  39.33 
 
 
166 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  42.28 
 
 
205 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40 
 
 
158 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  36.3 
 
 
147 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
181 aa  104  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.33 
 
 
158 aa  104  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.25 
 
 
157 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  39.33 
 
 
166 aa  104  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  39.33 
 
 
166 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  39.33 
 
 
166 aa  104  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.27 
 
 
150 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.05 
 
 
521 aa  104  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.13 
 
 
168 aa  104  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  38.67 
 
 
166 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.67 
 
 
166 aa  103  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.67 
 
 
166 aa  103  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  38.67 
 
 
166 aa  103  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  38.67 
 
 
166 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.36 
 
 
173 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  37.11 
 
 
200 aa  103  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1476  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.61 
 
 
151 aa  103  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  41.61 
 
 
148 aa  103  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1675  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.6 
 
 
197 aa  103  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000564994  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  38.36 
 
 
169 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  41.61 
 
 
148 aa  103  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.41 
 
 
146 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  39.04 
 
 
151 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  38.22 
 
 
167 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>