25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44679 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44679  predicted protein  100 
 
 
187 aa  386  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14802  predicted protein  42.34 
 
 
110 aa  98.2  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05040  endoplasmic reticulum protein, putative  35.87 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.575301  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13503  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.96 
 
 
129 aa  62.8  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.258058  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04039  Rhodanese domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03960)  36.63 
 
 
232 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.864941  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49253  predicted protein  32.35 
 
 
566 aa  47.8  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.836677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 
106 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  33 
 
 
107 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 
119 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  27.82 
 
 
131 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 
119 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 
119 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  26.79 
 
 
108 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.45 
 
 
389 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 
106 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1537  rhodanese-related sulfurtransferase  41.18 
 
 
106 aa  42.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  27.62 
 
 
102 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0624  Rhodanese domain protein  31.15 
 
 
149 aa  42  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 
109 aa  41.6  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
107 aa  41.2  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  29.29 
 
 
108 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  31 
 
 
107 aa  41.2  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  24.56 
 
 
113 aa  41.2  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  28.07 
 
 
134 aa  40.8  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>